The current COVID-19 pandemic and the previous SARS/MERS outbreaks of 2003 and 2012 have resulted in a series of major global public health crises. We argue that in the interest of developing effective and safe vaccines and drugs and to better understand coronaviruses and associated disease mechenisms it is necessary to integrate the large and exponentially growing body of heterogeneous coronavirus data. Ontologies play an important role in standard-based knowledge and data representation, integration, sharing, and analysis. Accordingly, we initiated the (...) development of the community-based Coronavirus Infectious Disease Ontology in early 2020. -/- As an Open Biomedical Ontology (OBO) library ontology, CIDO is open source and interoperable with other existing OBO ontologies. CIDO is aligned with the Basic Formal Ontology and Viral Infectious Disease Ontology. CIDO has imported terms from over 30 OBO ontologies. For example, CIDO imports all SARS-CoV-2 protein terms from the Protein Ontology, COVID-19-related phenotype terms from the Human Phenotype Ontology, and over 100 COVID-19 terms for vaccines (both authorized and in clinical trial) from the Vaccine Ontology. CIDO systematically represents variants of SARS-CoV-2 viruses and over 300 amino acid substitutions therein, along with over 300 diagnostic kits and methods. CIDO also describes hundreds of host-coronavirus protein-protein interactions (PPIs) and the drugs that target proteins in these PPIs. CIDO has been used to model COVID-19 related phenomena in areas such as epidemiology. The scope of CIDO was evaluated by visual analysis supported by a summarization network method. CIDO has been used in various applications such as term standardization, inference, natural language processing (NLP) and clinical data integration. We have applied the amino acid variant knowledge present in CIDO to analyze differences between SARS-CoV-2 Delta and Omicron variants. CIDO's integrative host-coronavirus PPIs and drug-target knowledge has also been used to support drug repurposing for COVID-19 treatment. -/- CIDO represents entities and relations in the domain of coronavirus diseases with a special focus on COVID-19. It supports shared knowledge representation, data and metadata standardization and integration, and has been used in a range of applications. (shrink)

Housed in one volume for the first time are several of the seminal essays on Du Bois's contributions to sociology and critical social theory: from DuBois as inventor of the sociology of race to Du Bois as the first sociologist of American religion; from Du Bois as a pioneer of urban and rural sociology to Du Bois as innovator of the sociology of gender and culture; and finally from Du Bois as groundbreaking sociologist of education and cultural criminologist to Du (...) Bois as critic of the disciplinary decadence of the discipline of sociology. Unlike any other anthology or critical reader on Du Bois, this new volume offers an excellent overview of the critical commentary on arguably one of the most imaginative and innovative, perceptive and prolific founders of the discipline of sociology. (shrink)

La Colombiade war bis zur französischen Revolution ein in Frankreich und in den westeuropäischen Ländern vielbeachtetes Epos. Aus heutiger Sicht ist das gut lesbare Gedicht erneut von Interesse: es wägt Segnungen und Schäden der Kolonialisierung gegeneinander ab, propagiert die Idee eines auf wissenschaftlichem und humanistischem Ethos gegründeten Europas, und artikuliert das aufklärerische Selbstbewusstsein einer schreibenden Frau. Die Einführung der Herausgeberin stellt das Gedicht in den Wissenshorizont der Entstehungszeit und skizziert die Rezeption. Der Anhang informiert über Textvarianten, bringt erläuternde Anmerkungen und (...) einen bibliographischen Informationsteil. (shrink)

Qu'entendons-nous par "bonheur"? Dépend-il de nos gènes, de la chance, de notre sensibilité? Est-ce un état durable ou une suite de plaisirs fugaces? N'est-il que subjectif? Faut-il le rechercher? Peut-on le cultiver? Souffrance et bonheur peuvent-ils coexister? Pour tenter de répondre à ces questions, Frédéric Lenoir propose un voyage philosophique, joyeux et plein de saveurs. Une promenade stimulante en compagnie des grands sages d'Orient et d'Occident. Où l'on traversera le jardin des plaisirs avec Epicure. Où l'on entendra raisonner le rire (...) de Montaigne et de Tchouang-tseu. Où l'on croisera le sourire paisible du Bouddha et d'Epictète. Où l'on goûtera à la joie de Spinoza et d'Etty Hillesum. Un cheminement vivant, ponctué d'exemples concrets et des dernières découvertes des neurosciences, pour nous aider à vivre mieux. (shrink)

Journal Name: Semiotica Issue: Ahead of print.

There is a tension in Emilie Du Châtelet’s thought on mathematics. The objects of mathematics are ideal or fictional entities; nevertheless, mathematics is presented as indispensable for an account of the physical world. After outlining Du Châtelet’s position, and showing how she departs from Christian Wolff’s pessimism about Newtonian mathematical physics, I show that the tension in her position is only apparent. Du Châtelet has a worked-out defense of the explanatory and epistemic need for mathematical objects, consistent with their metaphysical (...) nonfundamentality. I conclude by sketching how Du Châtelet’s conception of mathematical indispensability differs interestingly from many contemporary approaches. (shrink)

Much early modern metaphysics grew with an eye to the new science of its time, but few figures took it as seriously as Emilie du Châtelet. Happily, her oeuvre is now attracting close, renewed attention, and so the time is ripe for looking into her metaphysical foundation for empirical theory. Accordingly, I move here to do just that. I establish two conclusions. First, du Châtelet's basic metaphysics is a robust realism. Idealist strands, while they exist, are confined to non-basic regimes. (...) Second, her substance realism seems internally coherent, so her foundational project appears successful.I have two aims in this paper. Historically, I show that du Châtelet's main source of inspiration was Christian... (shrink)

Philosophers of science debate the proper role of non-epistemic value judgements in scientific reasoning. Many modern authors oppose the value free ideal, claiming that we should not even try to get scientists to eliminate all such non-epistemic value judgements from their reasoning. W. E. B. Du Bois, on the other hand, has a defence of the value free ideal in science that is rooted in a conception of the proper place of science in a democracy. In particular, Du Bois argues (...) that the value free ideal must be upheld in order to, first, retain public trust in science and, second, ensure that those best placed to make use of scientifically acquired information are able to do so. This latter argument turns out to relate Du Bois’ position on the value free ideal in science to his defence of epistemic democracy. In this essay I elaborate, motivate, and relate to the modern debate, Du Bois’ under-appreciated defence of the value free ideal. (shrink)

- Emilie du Châtelet offers an interesting and unusual account of the origin of our representation of extension. - She is an idealist about the essence extension, bodies and space, regarding them as mental constructs. - Du Châtelet's account requires a brute fact about the mind, in apparent tension with the Principle of Sufficient Reason.

Der Mensch als Übender, als sich durch Übungen selbst erzeugendes Wesen - Rainer Maria Rilke hat den Antrieb zu solchen Exerzitien zu Beginn des 20. Jahrhunderts in die Form gefaßt: "Du mußt dein Leben ändern." In seinem Plädoyer für die Ausweitung der Übungszone des einzelnen wie der Gesellschaft entwirft Peter Sloterdijk eine grundlegende und grundlegend neue Anthropologie. Den Kern seiner Wissenschaft vom Menschen bildet die Einsicht von der Selbstbildung alles Humanen. Seine Aktivitäten wirken unablässig auf ihn zurück: die Arbeit auf (...) den Arbeiter, die Kommunikation auf den Kommunizierenden, die Gefühle auf den Fühlenden. Es sind die ausdrücklich übenden Menschen, die diese Existenzweise am deutlichsten verkörpern: Bauern, Arbeiter, Krieger, Schreiber, Yogi, Rhetoren, Instrumentalvirtuosen oder Models. Ihre Trainingspläne und Höchstleistungen versammelt dieses Buch zu einer vergnüglich-instruktiven Lektüre von den Übungen, die erforderlich sind, ein Mensch zu sein. (shrink)

Considered one of the most important works of one of France's foremost philosophers, and long-awaited in English, "The Logic Of Sense" is an essay in literary and psychoanalytic theory, and philosophy, and helps to illuminate such works as "Anti-Oedipus".

This paper explores the theory of freedom that Emilie du Châtelet advances in her essay “On Freedom.” Using contemporary terminology, we can characterize this theory as a version of agent-causal compatibilism. More specifically, the theory has the following elements: (a) freedom consists in the power to act in accordance with one’s choices, (b) freedom requires the ability to suspend desires and master passions, (c) freedom requires a power of self-motion in the agent, and (d) freedom is compatible with moral necessity (...) but not with physical necessity. While these elements may at first appear disparate, the paper shows that they fit together quite well. The resulting theory is a surprising combination of doctrines that appear to be based on Samuel Clarke’s libertarian account of free will and doctrines that are reminiscent of the compatibilist accounts of John Locke, Anthony Collins, Gottfried Leibniz, and Thomas Hobbes. (shrink)

There is a growing consensus that Emilie Du Châtelet’s challenging essay “On Freedom” defends compatibilism. I offer an alternative, libertarian reading of the essay. I lay out the prima facie textual evidence for such a reading. I also explain how apparently compatibilist remarks in “On Freedom” can be read as aspects of a sophisticated type of libertarianism that rejects blind or arbitrary choice. To this end, I consider the historical context of Du Châtelet’s essay, and especially the dialectic between various (...) strands of eighteenth-century libertarianism and compatibilism. (shrink)

Le pari de cet ouvrage est d'explorer les facettes multiples à travers lesquelles se donne le soi. Parler de soi plutôt que de moi implique une rupture franche avec les philosophies qui placent le sujet humain en position fondatrice. Le soi est encore moins une « chose » mais un mode d'être ; le soi n'est pas une donnée mais une conquête dont le devenir est en partie indéterminé. C'est donc sous le signe des épreuves qu'il faut penser les variations (...) phénoménologiques et herméneutiques sur le soi. Si la philosophie reste la discipline dominante des réflexions qui parcourent les contributions du volume, l'originalité de cet ouvrage est d'offrir en même temps au lecteur d'autres variations par lesquelles se décline le soi. (shrink)

Chapitre 1. La constitution du sujet de la connaissance -- chapitre 2. Le grand renfermement néokantien -- chapitre 3. Les philosophies de la modernité réactionnaire.

Cet ouvrage d'histoire des idées et de philosophie des sciences rassemble plusieurs études dont le point commun est d'analyser les conséquences majeures de la découverte scientifique de l'infini. Ainsi, Alexandre Koyré montre comment la révolution galiléenne ou la découverte du calcul infinitésimal par Leibniz et Newton ont profondément modifié la conscience qu'a l'homme de lui-même et de sa place dans l'univers.

"Peut-on espérer dire la vérité sur le monde si ce que nous disons n'est pas du même ordre que ce que nous percevons? L'affirmation du silence des sens, qu'il soit le nom de leur mutisme, comme chez le philosophe d'Oxford John L. Austin, ou une dimension de leur signification originaire, comme chez le phénoménologue Maurice Merleau-Ponty, nous réduit-elle au silence? Cet ouvrage compare deux ententes du silence de la perception, développées des deux côtés de la Manche au milieu du vingtième (...) siècle, il examine les concepts de sens qui y sont convoqués et en déploie les conséquences épistémologiques contrastées. Par-delà la division analytico-continentale, il montre qu'aucune philosophie de la perception n'est pensable sans une philosophie du langage. Apparaît alors la situation métaphilosophique cruciale du concept de parole, par rapport auquel prend sens toute idée de silence, et qu'implique tout discours, ordinaire ou philosophique, qui en quelque manière interrompt celui-ci."--Page 4 de la couverture. (shrink)

The Southern Journal of Philosophy, EarlyView.

Résumé Dans cet article, nous discuterons de l’intégration du numérique à la sémiotique et proposerons qu’une modélisation conceptuelle puisse offrir un pont de dialogue entre ces deux domaines classiquement cloisonnés. Plus précisément, nous avancerons l’hypothèse que tout projet de recherche qui en appellera à l’informatique soit une démarche scientifique que s’il construit une théorie qui contient, en plus des modèles classiques que sont les modèles formel, computationnel et physique, un modèle conceptuel. Ce lieu, où les chercheur-es conceptualisent les multiples dimensions (...) de leur objet de recherche, sera alors défini en tant que socle d’une relation solide entre la sémiotique et l’informatique. Nous verrons que les différentes définitions du modèle conceptuel convergent vers la thèse soutenant que la connaissance scientifique met en œuvre une instance de conceptualisation qui doit identifier les diverses dimensions du problème en plus de devoir s’exprimer de manière à ce qu’elle soit communicable entre les membres des communautés épistémiques. Nous verrons, enfin, qu’un projet de recherché sémiotique exige la construction d’un tel modèle afin de décrire, généraliser et sélectionner des problèmes et que ce même modèle, conceptuel, sera aussi nécessaire si le ou la sémioticien-ne utilise l’informatique dans le cadre de sa recherche.fr. (shrink)

Often considered China's greatest poet, Du Fu (712-770) came of age at the height of the Tang dynasty, in an era marked by confidence that the accumulated wisdom of the precedent cultural tradition would guarantee civilization's continued stability and prosperity. When his society collapsed into civil war in 755, however, he began to question contemporary assumptions about the role that tradition should play in making sense of experience and defining human flourishing. In this book, Lucas Bender argues that Du Fu's (...) reconsideration of the nature and importance of tradition has played a pivotal role in the transformation of Chinese poetic understanding over the last millennium. In reimagining his relationship to tradition, Du Fu anticipated important philosophical transitions from the late-medieval into the early-modern period and laid the template for a new and perduring paradigm of poetry's relationship to ethics. He also looked forward to the transformations his own poetry would undergo as it was elevated to the pinnacle of the Chinese poetic pantheon. (shrink)

Le Traité Théologico-Politique, publié anonymement en 1670, fut sans doute le livre le plus scandaleux du XVIIe siècle, et pour cause : l'emploi d'une méthode critique radicale pour dévoiler les mystères du pouvoir théologique et politique faisait de cet ouvrage un traité aussi stimulant que polémique. Après trois cent cinquante ans, le Traité demeure un modèle de réflexion sur la politique, la philologie, la métaphysique et la religion. Dans ce volume, le lecteur trouvera un commentaire suivi de l'ouvrage. Grâce au (...) travail collectif des vingt-huit contributeurs, il pourra comprendre le détail du discours de Spinoza ainsi que saisir la trame de fond de la pensée spinoziste. L'ouvrage se compose de deux parties : le commentaire proprement dit et une section consacrée aux principaux problèmes qui animent le débat contemporain sur Spinoza. (shrink)

Gaston Fessard (1897-1978) fait partie des penseurs politiques qui se sont livrés à une actualisation de l'antique notion de bien commun. Cette actualisation, qui s'opère au croisement de la philosophie hégélienne et de la théologie chrétienne, confère à la notion de bien commun une fonction à la fois de compréhension historique et de discernement politique. Fessard montre par exemple en quoi la dialectique des catégories du bien commun explique la destinée des sociétés depuis la Révolution française jusqu'au conflit des idéologies (...) qui traversent le XXe siècle.0Il expose également la manière dont la dialectique de ses contenus fournit des critères pour juger du gouvernement de Vichy et fonder une résistance en conscience au pouvoir du maréchal Pétain. Cet ouvrage présente la pensée du bien commun de Fessard à travers ses sources (Thomas d'Aquin, Hegel et Marx) et concepts, son application durant la Seconde Guerre mondiale, les controverses dans lesquelles elle fut impliquée (avec Kojève et Mounier) ou par rapport auxquelles elle mérite d'être située (querelle du personnalisme).0Il propose aussi une actualisation critique de cette pensée politique, quant au rôle international de l'Eglise ou encore aux exigences de la démocratie. Car Fessard n'invite pas seulement à jeter un regard rétrospectif sur de "sombres temps", mais également à examiner notre propre actualité historique."--Page 4 of cover. (shrink)

Im Mittelpunkt der vorliegenden Studie steht die Frage nach der Tragweite und Anwendungsrelevanz der Methodenlehre Émilie du Châtelets für die Physik im 18. Jahrhundert, mit der sich die Französin an der Diskussion um Energie- und Impulserhaltung und um das Prinzip der kleinsten Wirkung beteiligte. Andrea Reichenberger zeigt, dass Prinzipien und Hypothesen für Émilie du Châtelet als Fundament und Gerüst wissenschaftlicher Erkenntnis gelten. Im Zusammenspiel beider Komponenten erweisen sich das Prinzip des Widerspruchs und das Prinzip des zureichenden Grundes als regulative Leitlinien (...) und Handlungsmaxime für die auf Hypothesen gestützte Theoriebildung und -begründung. Die sich daraus ergebenden Konsequenzen für den Status und Inhalt der Newtonschen Axiome werden exemplarisch aufgezeigt. (shrink)

Interprétation générale du système kantien répondant aux principes herméneutiques simples.

Peut-on prédire si un projet sera jugé socialement acceptable par ses principales parties prenantes? Dans un contexte où l’acceptabilité sociale en est venue à être considérée comme une condition à la réalisation de tout grand projet, cette question s’avère centrale pour tout développeur de projet, de même que pour les investisseurs qui les soutiennent. C’est dans cette perspective qu’a été développé l’Indice du risque social dans les projets miniers, une initiative soutenue par l’Autorité des marchés financiers à laquelle a travaillé (...) une équipe interdisciplinaire de chercheurs. Au-delà de jeter un éclairage sur la pertinence d’aller de l’avant ou non avec un projet, cet outil prédictif peut surtout permettre de moduler ledit projet, de concert avec ses parties prenantes, pour le rendre davantage acceptable à leurs yeux. Nous souhaitons ici rendre compte des possibilités offertes par cet indice en l’appliquant à deux projets miniers récemment discutés au Québec, soit le projet de mine aurifère développé par Osisko dans la municipalité de Malartic, en Abitibi-Témiscamingue, et celui de Mine Arnaud, à Sept-Îles, qui vise cette fois l’exploitation de l’apatite. Cet exercice nous permet de réaffirmer la pertinence de l’outil que constitue l’Indice, mais également de relever les limites qui lui sont inhérentes. (shrink)

Peut-on prédire si un projet sera jugé socialement acceptable par ses principales parties prenantes? Dans un contexte où l’acceptabilité sociale en est venue à être considérée comme une condition à la réalisation de tout grand projet, cette question s’avère centrale pour tout développeur de projet, de même que pour les investisseurs qui les soutiennent. C’est dans cette perspective qu’a été développé l’Indice du risque social dans les projets miniers, une initiative soutenue par l’Autorité des marchés financiers à laquelle a travaillé (...) une équipe interdisciplinaire de chercheurs. Au-delà de jeter un éclairage sur la pertinence d’aller de l’avant ou non avec un projet, cet outil prédictif peut surtout permettre de moduler ledit projet, de concert avec ses parties prenantes, pour le rendre davantage acceptable à leurs yeux. Nous souhaitons ici rendre compte des possibilités offertes par cet indice en l’appliquant à deux projets miniers récemment discutés au Québec, soit le projet de mine aurifère développé par Osisko dans la municipalité de Malartic, en Abitibi-Témiscamingue, et celui de Mine Arnaud, à Sept-Îles, qui vise cette fois l’exploitation de l’apatite. Cet exercice nous permet de réaffirmer la pertinence de l’outil que constitue l’Indice, mais également de relever les limites qui lui sont inhérentes. (shrink)

L’article de Karl Popper « Indeterminism in Quantum Physics and in Classical Physics » est tombé injustement dans l’oubli. Popper jugeait le déterminisme faux : l’avenir est ouvert. En principe, remplacer la variante de Laplace de la pré-détermination par une prédétermination prévisible permet de rendre scienti-fique, donc réfutable, le déterminisme « scientifique ». Popper a affirmé qu’il l’avait réfuté. Maintenant, un système métaphysique peut avoir une extension – au sens mathématique – qui le rend explicatif et testable. Si une extension (...) existe, alors elle n’est pas unique, et de nombreuses autres extensions alterna-tives existent. La preuve de Popper n’est alors pas concluante. (shrink)