Synthetic Biology and Renewal of the Ethics of the Research. From the Genome Editing to Organoids of the Brains In this paper I will address the philosophical and scientific impact brought up by “synthetic biology” from the beginning of embryogeny to the fabrication of organoids, to analyze how this paradigm shift impacts on our definition of what a good life is, or should be, in rehabilitation a dialog between sciences and philosophy.

[ENGLISH] This article discusses the potential of synthetic biology to address fundamental questions in the philosophy of biology regarding the nature of life and biological functions. Synthetic biology aims to reduce living organisms to their simplest forms by identifying the minimal components of a cell and also to create novel life forms through genetic reprogramming, biobrick assembly, or novel proteins. However, the technical success of these endeavors does not guarantee their conceptual success in defining life. There is a lack of (...) consensus among researchers on how to define and classify the entities produced in the lab, whether they should be considered living or categorized differently. The criteria for minimal cells and minimal life are subject to arbitrary choices and varying interpretations. The concept of function, crucial to synthetic biology, is also difficult to define. The article highlights the need to consider the minimal set of functions that characterize life before determining the smallest genomes that code for those functions. The arbitrary nature of defining both life and function complicates the understanding and classification of these entities. The article suggests that the traditional dichotomy between the living and the non-living may no longer be valid and that the concept of life itself may not require precise scientific definition. As synthetic biology advances, the article emphasizes the importance of redefining or constructing new categories to encompass the expanding possibilities and creations in the field. The ability to create new life forms raises questions about recognition, identification, and ethical implications, requiring a conceptual and philosophical engagement beyond the technical achievements of synthetic biology. -/- [FRENCH] L'article aborde le potentiel de la biologie synthétique pour répondre à des questions fondamentales de la philosophie de la biologie concernant la nature de la vie et des fonctions biologiques. La biologie synthétique vise à réduire les organismes vivants à leurs formes les plus simples en identifiant les composants minimaux d'une cellule et à créer de nouvelles formes de vie grâce à la reprogrammation génétique, à l'assemblage de biobriques ou à des protéines nouvelles. Cependant, le succès technique de ces approches ne garantit pas leur réussite conceptuelle dans la définition de la vie. Il n'y a pas de consensus parmi les chercheurs sur la façon de définir et de classer les entités produites en laboratoire, qu'elles doivent être considérées comme vivantes ou catégorisées différemment. Les critères des cellules minimales et de la vie minimale sont soumis à des choix arbitraires et à des interprétations variables. La notion de fonction, essentielle en biologie synthétique, est également difficile à définir. L'article met en évidence la nécessité de prendre en compte l'ensemble minimal de fonctions qui caractérisent la vie avant de déterminer les plus petits génomes qui codent ces fonctions. La nature arbitraire de la définition de la vie et de la fonction complique la compréhension et la classification de ces entités. L'article suggère que la dichotomie traditionnelle entre le vivant et le non-vivant pourrait ne plus être valable et que le concept même de vie ne nécessite pas une définition scientifique précise. À mesure que la biologie synthétique progresse, l'article souligne l'importance de redéfinir ou de construire de nouvelles catégories pour englober les possibilités et créations croissantes dans le domaine. La capacité à créer de nouvelles formes de vie soulève des questions de reconnaissance, d'identification et d'implications éthiques, nécessitant une réflexion conceptuelle et philosophique au-delà des avancées techniques de la biologie synthétique. (shrink)

Die sich um 1800 neu konstituierende Disziplin der Biologie und die idealistische Naturphilosophie Schellings bemuhen sich in ihrer Frontstellung gegen einen unkritisch und ontologisch verstandenen Mechanismus um eine dem Leben angemessene Beschreibung und Erklarung der Lebensphanomene. Vor diesem Hintergrund wird im ersten Teil der vorliegenden Studie das Werk des Naturforschers Carl Friedrich Kielmeyer im Kontext der zeitgenossischen philosophischen und naturforschenden Diskussionen verortet, bevor im zweiten Teil die Bedeutung von Kielmeyers Phanomenologie des Organischen fur die systematische Ausarbeitung des Schelling'schen Systems (...) der Naturphilosophie aufgezeigt wird. In their animosity towards an uncritical and ontology-based mechanism, both the new discipline of biology, which was becoming established around 1800, and Schellings idealistic natural philosophy strove for a description and explanation of the phenomena of life which were pertinent to life. Against this backdrop, the work of the naturalist Carl Friedrich Kielmeyer is placed in the context of contemporary philosophical and naturalist discussions of the time in the first part of this study before the significance of Kielmeyers phenomenology of the organic for the systematic development of Schellings system of natural philosophy is shown in the second part. (shrink)

Dans un monde dominé par les conflits, il arrive qu’il faille se défendre. L’invention des armes a évolué en parallèle avec le savoir technique, puis scientifique, et il est même arrivé que la recherche d’applications militaires ait joué un rôle moteur dans la découverte scientifique. Lorsque les armes ne servent pas à attaquer d’autres nations, leur fabrication et leur commerce se justifient morale- ment. Il faut cependant qu’elles ne puissent échapper à ceux qui les construisent et doivent en contrôler la (...) diffusion. Facilement mise en œuvre, la guerre utilisant des organismes vivants ou ce qu’ils pro- duisent comme armes est très ancienne. Or l’originalité des êtres vivants est qu’ils se multiplient, qu’un seul individu suffit à recouvrir la Terre de ses descendants. La biologie ne se prête jamais à un usage militaire moralement défendable parce que le confinement au champ de bataille est impossible. De ce fait, les applications de la biologie ont été vite écartées du domaine de la Défense permise par les traités internationaux. La Convention de 1972 sur l’Interdiction des Armes Biologiques et à Toxines (CIABT), entrée en vigueur en 1975, est aujourd’hui signée par 183 pays (ratifiée par 175) sur un total de 193, sans compter Taïwan qui l’a ratifiée mais n’est pas reconnu par l’ONU. Elle interdit la mise au point, la fabrication, l’acquisition, le transfert, la conservation, le stockage et l’utilisation des armes bio- logiques et à toxines. Elle constitue un élément essentiel de la lutte contre la prolifération des armes de destruction massive. (shrink)

Comment, à la fin du XVIIIe siècle, la physiologie cérébrale est progressivement intégrée dans la philosophie positive, puis modifiée en fonction des objectifs théoriques et politiques poursuivis par Auguste Comte.

La philosophie de la biologie est un domaine extrêmement actif de la recherche dans la tradition philosophique anglo-saxonne. Elle réunit philosophes et biologistes autour de la question de la définition des concepts fondamentaux : gène, cellule, organisme, espèce, développement, évolution, adaptation, etc. Ce livre, qui rassemble les contributions d’une trentaine de spécialistes français et étrangers, présente en 24 chapitres l’état de la recherche actuelle dans tous les principaux domaines de la biologie. Il peut être utilisé comme manuel pour (...) les cours de philosophie des sciences au niveau Master. (shrink)

-/- Table des matières Remerciements 1 -/- INTRODUCTION 2 -/- PREMIERE PARTIE LE VIVANT ET LA REVOLUTION SCIENTIFIQUE 7 -/- ONTOLOGIE DU VIVANT OU BIOLOGIE ? LE CAS DE LA RÉVOLUTION SCIENTIFIQUE 8 -/- Introduction 8 La vie et le vivant sont-ils des thèmes de controverse explicites dans la philosophie naturelle de l’âge classique ? 18 Machines de la nature, ferments et métaphysique chimique 28 Crisis, what crisis ? 42 Conclusion 45 -/- LE MÉCANIQUE FACE AU VIVANT 49 -/- (...) Introduction 49 Que signifie : réduire l’homme (ou le vivant) à l’automate ? 51 Qu’est-ce qu’un vivant ? Un mécanisme élargi 56 Le vivant structuro-fonctionnel 64 Conclusion : l’automate affectif 70 -/- UN MATÉRIALISME VITAL ? 73 -/- Introduction : matérialisme et corps 73 Ontologie matérialiste de la Vie ou constitution progressive de la biologie ? 74 Un matérialisme vital 78 Conclusion 84 -/- DEUXIEME PARTIE MATÉRIALISMES ET VIE 87 -/- DÉTERMINISME MENTAL ET NATURALISATION DE L’ESPRIT, DE LOCKE A DIDEROT 88 -/- Introduction 89 Le déterminisme à l’âge classique et son interprétation 89 L’Âme Matérielle et le Traité de la liberté de l’âme : un déterminisme cérébral 94 Locke : la détermination est une perfection 101 Collins : suspendre son vouloir, c’est encore vouloir 105 Diderot : les « causes propres à l’homme » 111 Conclusion 115 -/- LA METTRIE : LA MÉDICALISATION DE LA MORALE ET L’APPROCHE MATÉRIALISTE DU CORPS 117 -/- Introduction 117 Une morale médicale ? 117 La réduction médicale de la morale 120 L’épicurisme médical 125 Une éthique machinale 130 Conclusion 132 -/- DES MOLÉCULES « INTELLIGENTES » A L’ORGANISATION ÉMERGENTE : LE DÉBAT MAUPERTUIS-DIDEROT 134 -/- Introduction 134 Le contexte newtonien et leibnizien 137 L’argument de Maupertuis 139 La critique de Diderot 143 La réponse de Maupertuis 145 Conclusion : enjeux de la discussion 147 -/- UNE BIOLOGIE CLANDESTINE ? LE PROJET D’UN SPINOZISME BIOLOGIQUE CHEZ DIDEROT 150 -/- Introduction 150 Diderot et la biologie 152 Excursus : la naissance de la biologie 155 Spinozistes anciens et modernes 161 Spinozisme et spinosisme 166 Conclusion 168 -/- TROISIEME PARTIE VITALISME 170 -/- ORGANISATION OU ORGANISME ? L’INDIVIDUATION ORGANIQUE SELON LE VITALISME MONTPELLIÉRAIN 171 -/- Introduction : pour introduire au vitalisme de Montpellier 171 Machine et organisation 174 Le concept vitaliste d’organisation, entre Vie et vies 179 Quelle individualité organique ? 186 Organisation ou organisme 190 Conclusion 197 -/- LES ANALOGIES NEWTONIENNES DANS LES SCIENCES DE LA VIE AU XVIIIE SIÈCLE : VITALISME ET PROCÉDÉS EXPLICATIFS PROVISOIREMENT INEXPLICABLES 200 -/- Introduction 200 Le newtonianisme médical littéral 206 Les transpositions non-littérales de la méthode newtonienne : Buffon, Maupertuis et Hartley 212 Haller : une physiologie de « noms d’attente » 216 Le vitalisme du XVIIIe siècle, un « positivisme prudent » plutôt qu’une « métaphysique impénitente » 220 L’antimathématisme de Mandeville et de Diderot 233 Conclusion 240 -/- VITALISME ET VIVISECTION : APPROCHES VITALISTES DE L’EXPÉRIMENTATION ANIMALE 245 -/- Introduction 245 Considérations préliminaires sur le XVIIe siècle 248 L’École de Montpellier 251 Ménuret de Chambaud 255 Un intermezzo sur Diderot 260 Fouquet et Bordeu contre Haller 263 Conclusion 267 -/- LE CHARME DISCRET DU VITALISME SANS MÉTAPHYSIQUE, XVIIIe - XXe SIÈCLES 272 -/- Introduction 272 Vitalisme substantiel et vitalisme fonctionnel 274 Vitalisme et biologie 279 Conclusion 283 -/- QUATRIEME PARTIE ORGANISME ET BIOPHILOSOPHIE 285 -/- L’ORGANISME : CONCEPT HYBRIDE ET POLÉMIQUE 285 -/- Introduction 286 L’organisme, un hybride 287 L’organisme comme individualité 290 Organisme et organicisme 296 L’organisme vitaliste 301 Ontologie de l’organisme 303 Conclusion 305 -/- LE RETOUR DU VITALISME : CANGUILHEM ET LE PROJET D’UNE BIOPHILOSOPHIE 307 -/- Introduction 307 Un vitalisme passe-partout 308 L’organisme entre épistémologie et ontologie 312 Une métaphysique de l’oursin ? Bioexceptionalisme et biochauvinisme 313 Vitalisme versus mysticisme de la chair 317 Conclusion 323 -/- HOLISME, ORGANICISME ET BIOCHAUVINISME 327 -/- Introduction : organicismes forts et faibles 327 Le holisme et l’organicisme plurivoques 329 Deux remarques critiques au sujet de deux périls étrangement connexes de la théorie holiste-organiciste 333 Holisme, biochauvinisme et subjectivité 337 Conclusion 341 -/- CONCLUSION : LA PHILOSOPHIE DE LA BIOLOGIE AVANT LA BIOLOGIE 345 -/- Bibliographie 350 Index 404. (shrink)

Cet ouvrage proposé un panorama complet des débats contemporains en philosophie de la biologie. Il consacre une large place à la représentation des principes fondateurs de la théorie de l'évolution et des principaux concepts et lois génétiques, ainsi qu'à l'examen des questions posées par la sélection naturelle comme par la notion de fitness et l'unité de sélection. L'auteur discute en ces pages la définition du vivant et la potion de fonction biologique, et développe notamment une conception causale et mécaniste (...) des processus biologiques dans une perspective réductionniste originale. Clair et didactique, cet ouvrage résume systématiquement l'état actuel des connaissances, présente les différents concepts et positions, propose une évaluation des résultats et montre que les questions ouvertes dépasse largement le seul cadre de la biologie. Il vise ainsi à contribuer au développement d'une philosophie de la biologie nouvelle, en lien étroit avec la philosophie des sciences dans son ensemble. (shrink)

En el primer capítulo de su libro Duchesneau aborda la cuestión de lo que es una especie, algo de difícil solución porque el de especie es un concepto de una potencia heurística inmensa y, a la vez, está lleno de agujeros que se hacen patentes en cuanto se pretende hilar fino para definirlo. Las alternativas entre la especie como grupo reproductivo -la "especie biológica"- y como secuencia evolutiva -la "especie filogenética"-, con sus respectivas precisiones internas, están bien planteadas por el (...) autor. También lo está la más reciente "especie ecológica", de talante adaptacionista. Duchesneau no pretende argumentar en favor de uno u otro concepto, sino indicar que existen, y de su postura aséptica se deduce que, probablemente, es imposible reducir ninguno de esos conceptos al otro. Pero esa conclusión tropieza de inmediato con el asunto que aborda Duchesneau en el epígrafe siguiente de su libro: la taxonomía. Porque en algo coinciden al menos quienes emplean especies biológicas, filogenéticas y ecológicas: en darles un nombre. No es raro, pues, que la sistemática sea en estos momentos una de las disciplinas que tenga más interrogantes por resolver. (shrink)

In his study on 'schelling's and hegel's verhaltnis zur naturwissenschaft' of 1844 m j schleiden, one of the leading biologists of that time, opposed the speculative idealism. his work marks the change of the german biology to a science that is founded on materialistic assumptions. it gives the essence of a discussion that is not only interesting in a historical perspective but accentuated an ongoing controversy.

La littérature épistémologique actuelle véhicule une image caricaturale de la philosophie popperienne de la biologie. En effet, on suppose sa position suffisamment claire et univoque pour pouvoir se résumer succinctement en quelques lignes. De plus, on la suppose toujours la même tout au long de l'évolution intellectuelle de son auteur. Dans le présent article, nous voudrions contester ces deux suppositions car sa pensée est non seulement vague et ambiguë mais encore elle est loin d'être constante et homogène. De ce (...) fait, nous entendons corriger une conception eronnée et généralement répandue de sa philosophie de la biologie.Popper's philosophy of biology is generally miscon- ceived. It is supposed to be homogeneous and clearly statable in a few lines. Worse, Popper's changes of mind on these questions are not even taken into account. In this article, we will try to show why these suppositions are erroneous and how they hinder us from forming a more adequate idea of his philosophy of biology. (shrink)

introduction to special issue I edited on philo. of biology.

Philosophe, l'auteur tente de resituer le mouvement de la pensée d'Hannah Arendt, ses grandes articulations et ce qui fait d'elle un auteur majeur et précurseur.